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Software List
Some commercially purchased software is
controlled
by license keys which limit the number of concurrent users. Our scheduling
system recognises a "software" resource flag to prevent
jobs starting when the appropriate number of license keys is not
available. It is important
that all users use the software flag for the package. These flags are
provided as part of the documented example in each of the links below.
More information on accounts for the National Facility can be found on the NCI National Facility home page.
Environment Modules
Environment Modules provide a great way to easily customize your shell environment to the requirements of whatever software you wish to use. The module command syntax is the same no matter which command shell you are using. They are available on the ac,xe,lc, and dc.
The
indicates software that requires some discussion with the facility staff before using. You should read the "How To Use" section of the software for the host for more details.
The hostname suffix tag "-" (eg ac-) means that the software installation is in progress.
Click here to see the list of recently installed software
| Computational Chemistry | Bioinformatics | Math Libraries | Statistics & Mathematics Environments | ||||||||||||||||||||
| ABINIT | ac | lc | BEAST | ac | ARPACK and PARPACK | ac | Cactus | lc | |||||||||||||||
| ACES II | ac | BIOPERL | ac | lc | BLACS | ac | Maple | ac | lc | ||||||||||||||
| ADF | ac | BIOPYTHON | ac | lc | BLAS | ac | lc | Mathematica | ac | lc | |||||||||||||
| Amber | ![]() | ac | lc | BLAST | ac | lc | Boost | ac | lc | dc | Matlab | lc | dc | store | |||||||||
| AutoDock | ![]() | lc | HMMER | ac | lc | CPLEX | ac | Octave | ac | lc | |||||||||||||
| CASTEP | ![]() | ac | mpiBLAST | ac | lc | FFTW | ac | lc | dc | PETSc | ac | lc | |||||||||||
| CCP4 | lc | MrBayes | ac | lc | GSL | ac | lc | dc | R | ac | lc | dc | |||||||||||
| CHARMM | ![]() | ac | lc | LAPACK | ac | lc | Stata | ![]() | ac | ||||||||||||||
| Columbus | lc | LIBGOTO | ![]() | ac | lc | ||||||||||||||||||
| CPMD | ![]() | ac | MKL | ac | lc | dc | |||||||||||||||||
| DALTON | ac | NAG | ![]() | ac | lc | ||||||||||||||||||
| deMon | ![]() | ac | Scalapack | ac | |||||||||||||||||||
| Discover | ![]() | ac | SCSL | ac | |||||||||||||||||||
| DMol3 | ![]() | ac | Tao | ac | |||||||||||||||||||
| ESPResSo | ac | ||||||||||||||||||||||
| Gamess-PLUS | ac | ||||||||||||||||||||||
| Gamess-US | ac | lc | |||||||||||||||||||||
| Gaussian | ![]() | ac | lc | ||||||||||||||||||||
| GaussView | ![]() | ac | lc | ||||||||||||||||||||
| GROMACS | ac | lc | |||||||||||||||||||||
| GULP | ![]() | ac | |||||||||||||||||||||
| LAMMPS | ac | ||||||||||||||||||||||
| MCCCS-Towhee | ac | ||||||||||||||||||||||
| Migrate | lc | ||||||||||||||||||||||
| Molcas | ac | ||||||||||||||||||||||
| Molden | ac | lc | |||||||||||||||||||||
| Molpro | ac | lc | |||||||||||||||||||||
| MOPAC | ![]() | ac | lc | ||||||||||||||||||||
| MRCC | ac | ||||||||||||||||||||||
| NAMD | ![]() | ac | |||||||||||||||||||||
| NW-Chem | ![]() | ac | |||||||||||||||||||||
| Open Babel | ac | ||||||||||||||||||||||
| PWscf | ac | ||||||||||||||||||||||
| Quantum ESPRESSO | ac | ||||||||||||||||||||||
| SAPT | ac | lc | |||||||||||||||||||||
| SIESTA | ![]() | ac | |||||||||||||||||||||
| SMXGAUSS | ac | ||||||||||||||||||||||
| TURBOMOLE | ac | lc | |||||||||||||||||||||
| VASP | ![]() | ac | |||||||||||||||||||||
| VMD | ac | lc | |||||||||||||||||||||
| WIEN2k | ![]() | ac | |||||||||||||||||||||
| XPLOR-NIH | ac | ||||||||||||||||||||||
| CFD & Engineering | Climate Modelling & Earth Systems | Geophysics | Geospatial tools | ||||||||||||||||||||
| ABAQUS | ![]() | ac | CCSM3 | ac | escript/Finley | ![]() | ac | ArcInfo | store | ||||||||||||||
| Fluent | ![]() | ac | lc | CSIRO Mk3L | ![]() | ac | snark | ac | GDAL | dc- | |||||||||||||
| LS-Dyna | ![]() | ac | ESCM | ac | lc | StGermain | ac | GRASS | dc | ||||||||||||||
| ferret | ac | lc | store | Underworld | ac | PROJ.4 | dc | store | |||||||||||||||
| NCARG | ac | lc | |||||||||||||||||||||
| NCL | ac | ||||||||||||||||||||||
| POM | ac | lc | |||||||||||||||||||||
| Astronomy & Astrophysics | Photonics | Parallel Programming Libraries/Tools | Compilers | ||||||||||||||||||||
| AIPS++ | ac- | FullWAVE | ac | Global Array (GA) Tools | ![]() | ac- | C and C++ | ac | lc | dc | store | ||||||||||||
| FITS | store- | GNU Pthreads | ac- | Fortran | ac | lc | dc | store | |||||||||||||||
| fitsio | store | MCT | ac | HPF | lc | ||||||||||||||||||
| ftools | store | MPT/MPI | ac | lc | |||||||||||||||||||
| fv | store | PVM | ac | lc | |||||||||||||||||||
| IRAF | ac- | lc | store | ||||||||||||||||||||
| SAOImage DS9 | store | ||||||||||||||||||||||
| STSDAS | store | ||||||||||||||||||||||
| xfitsview | store | ||||||||||||||||||||||
| Debuggers & Profilers & Simulators | Code Development Utilities | Scripting Languages | Editors | ||||||||||||||||||||
| DDD | ac | dc | CVS | ac | lc | store | java | ac | dc | Emacs | ac | lc | dc | store | |||||||||
| Electric Fence | ac | lc | FLTK | ac | Perl | ac | lc | dc | store | nano | ac | ||||||||||||
| Intel Debugger | ac | lc | Git | ac | dc | Python | ac | lc | dc | store | nedit | ac | lc | ||||||||||
| Intel Trace Analyzer | ac | subversion | ac | lc | dc | store | Ruby | dc | Vim | ac | lc | store | |||||||||||
| Intel Trace Collector | ac | Tcl/Tk | ac | lc | dc | store | |||||||||||||||||
| Jumpshot | ac | lc | |||||||||||||||||||||
| Simics | lc | ||||||||||||||||||||||
| Totalview | ac | ||||||||||||||||||||||
| valgrind | lc | dc | |||||||||||||||||||||
| File Formats & Data management packages | Data Mining | Graphics | Network Access and Grid Services | ||||||||||||||||||||
| FITS | store- | lucene | dc- | CCP4 | lc | ftp | store | ||||||||||||||||
| HDF4 | ac | lc | dc | store | ferret | ac | lc | store | Globus | ac | lc | dc | store | ||||||||||
| HDF5 | ac | lc | dc | Freesurfer | ac | lc | GridFTP | ac | lc | dc | store | ||||||||||||
| IRAF | ac- | lc | store | FSL | lc | MacFUSE sshfs | ac | ||||||||||||||||
| mysql | ![]() | dc | store | GMT | ac | lc | store | ncftp | store | ||||||||||||||
| NCO | ac | GNUplot | ac | lc | dc | store | OPeNDAP | ![]() | dc | store | |||||||||||||
| netCDF | ac | lc | dc | store | Grace | ac | lc | sftp | ac | lc | store | ||||||||||||
| netpbm | ac | Houdini | lc | SRB | ac | lc | dc | store | |||||||||||||||
| postgres | ![]() | ac | lc | dc | store | IDL | lc | ssh | ac | lc | dc | store | |||||||||||
| libFAME | ac | VNC | ac | lc | |||||||||||||||||||
| MESA | ac | lc | dc | store | |||||||||||||||||||
| NCARG | ac | lc | |||||||||||||||||||||
| NCL | ac | ||||||||||||||||||||||
| Ncview | ac | dc | |||||||||||||||||||||
| netpbm | ac | ||||||||||||||||||||||
| PDL | ac | lc | |||||||||||||||||||||
| PGplot | ac | lc | store | ||||||||||||||||||||
| SAOImage DS9 | store | ||||||||||||||||||||||
| VMD | ac | lc |
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